CDC bevestigt dat COVID-19 al in januari in de VS werd gedetecteerd

CDC bevestigt dat het coronavirus al in januari werd ontdekt
CDC bevestigt dat het coronavirus al in januari werd ontdekt
Geschreven door Hoofdopdrachteditor

Van 21 januari tot 23 februari 2020 ontdekten volksgezondheidsinstanties 14 Amerikaanse gevallen van coronavirus 2019 (COVID-19), allemaal gerelateerd aan reizen vanuit China (1,2). Het eerste niet-reisgerelateerde Amerikaanse geval werd bevestigd op 26 februari in een inwoner van Californië die op 13 februari ziek was geworden (3). Twee dagen later, op 28 februari, werd een tweede niet-reisgerelateerde zaak bevestigd in de staat Washington (4,5). Onderzoek van vier bewijslijnen geeft inzicht in de timing van introductie en vroege overdracht van SARS-CoV-2, het virus dat COVID-19 veroorzaakt, in de Verenigde Staten voordat deze twee gevallen werden ontdekt.

Ten eerste vertoonde syndromale surveillance op basis van gegevens van de afdeling spoedeisende hulp van provincies die vroeg door de pandemie waren getroffen, geen toename van het aantal bezoeken voor COVID-19-achtige ziekte vóór 28 februari. Amerikaanse locaties vanaf 2 januari identificeerden geen positieve resultaten vóór 11,000 februari. Ten derde suggereerde analyse van virale RNA-sequenties uit vroege gevallen dat een enkele lijn van virus dat direct of indirect uit China werd geïmporteerd in de Verenigde Staten begon te circuleren tussen 1 januari en 20 februari, gevolgd door door verschillende SARS-CoV-18-importen uit Europa.

Ten slotte het geval van drie gevallen, één in een inwoner van Californië die stierf op 6 februari, een tweede in een andere inwoner van dezelfde provincie die op 17 februari stierf, en een derde in een niet-geïdentificeerde passagier of bemanningslid aan boord van een cruiseschip uit de Stille Oceaan dat vertrok. San Francisco bevestigt op 11 februari de cryptische circulatie van het virus begin februari. Deze gegevens geven aan dat aanhoudende overdracht vanuit de gemeenschap was begonnen voordat de eerste twee niet-reisgerelateerde gevallen in de VS waren ontdekt, waarschijnlijk als gevolg van de invoer van een enkele viruslijn uit China eind januari of begin februari, gevolgd door verschillende invoer uit Europa. De wijdverbreide opkomst van COVID-19 in de Verenigde Staten na februari onderstreept het belang van robuuste volksgezondheidsstelsels om snel te reageren op opkomende besmettelijke bedreigingen.

Syndroom toezicht

Via het National Syndromic Surveillance Program ontvangen Amerikaanse volksgezondheidsinstanties real-time gegevens van spoedeisende hulpafdelingen in ongeveer 4,000 zorginstellingen in 47 Amerikaanse staten en het District of Columbia. In 14 provincies met vroege buiten het ziekenhuis opgelopen gevallen van COVID-19, werd geen substantiële toename waargenomen in het aantal COVID-19-achtige ziekten (koorts en hoesten of kortademigheid of ademhalingsmoeilijkheden, of de vermelding van een coronavirus-diagnostische code) vóór 28 februari.

Surveillance voor acute SARS-CoV-2-infectie De Seattle Flu Study (5) begon in november 2018 met het monitoren van acute luchtwegaandoeningen in het grootstedelijk gebied van Seattle. Eind februari 2020 begon de studie met het testen van monsters met behulp van reverse transcriptie-polymerasekettingreactie (RT- PCR) testen op SARS-CoV-2. Het eerste positieve laboratoriumresultaat voor SARS-CoV-2 werd gedetecteerd op 28 februari van een monster dat op 24 februari was verzameld. Na deze detectie werden eerder verzamelde gedeïdentificeerde monsters retrospectief op het virus getest. Er waren geen positieve resultaten bij 5,270 respiratoire specimens die tijdens 1 januari - 20 februari (5) waren verzameld (T. Bedford, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, Washington, persoonlijke mededeling, 6 mei 2020). Het eerste specimen dat positief testte onder deze retrospectief geteste specimens was verzameld op 21 februari. Tijdens de week die begon op 21 februari testten acht van 1,255 specimens (0.6%) positief en in de daaropvolgende week werden 29 van 1,862 (1.6%) geteste specimens positief. Twee netwerken voor onderzoek naar de effectiviteit van griepvaccins met locaties in zes staten (Michigan, Pennsylvania, Tennessee, Texas, Washington en Wisconsin) testten retrospectief respiratoire specimens van patiënten met acute respiratoire aandoeningen op SARS-CoV-2 door RT-PCR. Op de locatie in Washington was geen van de 497 exemplaren die tijdens 19 januari - 24 februari waren verzameld, positief; het eerste exemplaar dat positief testte, werd verzameld op 25 februari. Op de vijf andere locaties (Ann Arbor en Detroit, Michigan; Pittsburgh, Pennsylvania; Temple, Texas; Marshfield, Wisconsin; en Nashville, Tennessee) werd geen van de 2,620 monsters verzameld in januari 19 - 29 februari testten positief voor SARS-CoV-2. Vanaf 22 mei 2020 zijn vier (<0.2%) van de ongeveer 3,000 monsters verzameld van kinderen en adolescenten <18 jaar die in het New Vaccine Surveillance Network † tussen 1 januari en 31 maart waren opgenomen, positief getest op SARS-CoV-2. Het eerste positieve resultaat was van een exemplaar dat op 20 maart in Seattle was verzameld.

Fylogenetische analyse

Analyse van de genomische diversiteit van SARS-CoV-2 uit vroege gevallen van COVID-19 uit de omgeving van Seattle wees uit dat de meeste virussen tot een enkele clade behoorden (de clade van de staat Washington), waarvan werd geschat dat de meest recente gemeenschappelijke voorouder bestond tussen ongeveer 18 januari en 9 februari (puntschatting = 1 februari) .§ De voorspelde genomische sequentie van dat voorlopervirus was consistent met die van het eerste Amerikaanse geval van geïmporteerde COVID-19, dat zich voordeed bij een man die vanuit Wuhan, China in Seattle aankwam. , op 15 januari en werd 4 dagen later ziek. Het is echter ook mogelijk dat de clade van de staat Washington is ontstaan ​​uit een virus met een vergelijkbare of identieke sequentie van een andere persoon met SARS-CoV-2-infectie. Analyse van virussen in Californië en het noordoosten van de Verenigde Staten van februari tot half maart suggereerde dat er verschillende virussen waren geïmporteerd, voornamelijk uit Europa, gevolgd door overdracht van virussen binnen de Verenigde Staten.

Bekende gevallen bij personen zonder relevante reisgeschiedenis

Vóór 26 februari deden zich twee opmerkelijke gevallen van COVID-19 voor in Santa Clara County, Californië: een bij een vrouw die op 31 januari ziek werd en stierf op 6 februari en een bij een niet-verwante man die tussen 13 en 17 februari thuis stierf. Geen van beiden had internationaal gereisd in de weken voorafgaand aan hun dood. SARS-CoV-2-RNA werd gedetecteerd door RT-PCR-testen bij CDC van postmortale weefselmonsters van deze patiënten. Deze sterfgevallen werden door een keuringsarts verklaard als COVID-19-geassocieerde sterfgevallen. Het onderzoek naar deze gevallen is aan de gang. Uitbraken van COVID-19 deden zich voor tijdens twee opeenvolgende reizen van een Grand Princess-cruiseschip (7). De genomische sequentie van virussen van deze uitbraken bevond zich binnen de clade van de staat Washington, wat suggereert dat een passagier of bemanningslid besmet met dat virus aan boord was toen het op 11 februari de haven van San Francisco verliet voor een rondvaart. De identiteit van die persoon is onbekend. Discussie Informatie uit deze diverse gegevensbronnen suggereert dat er tussen de tweede helft van januari en begin februari een beperkte overdracht van SARS-CoV-2 in de Verenigde Staten plaatsvond na de invoer van SARS-CoV-2 uit China. Deze invoer leidde tot een afstamming, de clade van de staat Washington, die zich vervolgens verspreidde over het grootstedelijk gebied van Seattle en mogelijk elders. In februari en maart volgden verschillende importen van SARS-CoV-2 uit Europa. Het is niet bekend hoeveel US infecties traden op in februari en maart, maar de algehele incidentie van ziekten vóór 28 februari was te laag om te worden opgespoord door middel van syndromale surveillancegegevens van de spoedeisende hulp. Eveneens onbekend zijn de data van binnenkomst van de geïmporteerde virussen in de Verenigde Staten en de identiteit van de personen die ze droegen. Een mogelijke vroege bron is de eerste gerapporteerde VS. geval van COVID-19, dat zich voordeed bij een man uit Washington die op 19 januari ziek werd na zijn terugkeer uit Wuhan, China, op 15 januari; de genomische sequentie van het virus dat uit die man is geïsoleerd, komt overeen met het feit dat hij de mogelijke bron is van de clade van de staat Washington, hoewel de grondigheid van het contactonderzoek van deze zaak en het ontbreken van geïdentificeerde secundaire gevallen hiertegen pleiten (8). Uit daaropvolgende gepubliceerde rapporten is echter gebleken dat infectie met SARS-CoV-2 vaak asymptomatisch is en dat overdracht kan plaatsvinden voordat de symptomen zich voordoen (9). De mogelijkheid van presymptomatische overdracht roept ten minste drie andere mogelijke scenario's op met betrekking tot dit geval: 1) dat een of meer secundaire asymptomatische infecties kunnen zijn opgetreden onder de contacten van de patiënt en dat deze hebben geleid tot verdere, niet-ontdekte verspreiding van het virus; 2) dat de man mogelijk geïnfecteerde contacten heeft gehad vóór het begin van zijn symptomen (dergelijke contacten zouden op dat moment niet zijn geïdentificeerd via het standaard aanbevolen contactonderzoek); of 3) dat hij en ten minste één andere persoon besmet waren door een andere passagier op dezelfde vlucht vanuit Wuhan, en dat onopgemerkt verspreiding van de andere besmette personen aanleiding gaf tot de clade van de staat Washington. Welke van deze scenario's zich eventueel hebben voorgedaan, zal waarschijnlijk nooit bekend worden. Het is ook mogelijk, gezien de beperkte wereldwijde fylogenetische diversiteit van SARS-CoV-2 in die tijd, dat de clade van de staat Washington rond dezelfde tijd door een andere, onbekende persoon in de Verenigde Staten werd geïmporteerd. De resultaten van serologische tests worden hier niet weergegeven, omdat serologie (dwz testen op antilichamen tegen SARS-CoV-2) waarschijnlijk een relatief ongevoelig middel is om een ​​nieuw opkomend virus te detecteren, vooral wanneer de monsters willekeurig werden verzameld in plaats van van personen die het meest waarschijnlijk zijn geïnfecteerd (in tegenstelling tot bijvoorbeeld virale tests van poliklinische patiënten of ziekenhuispatiënten met acute respiratoire aandoeningen) en omdat serologische tests in het algemeen niet de 100% specificiteit benaderen tenzij er een of andere vorm van bevestigende tests beschikbaar is. Een hypothetisch serologisch onderzoek in het grootstedelijk gebied van Seattle (3.5 miljoen inwoners) uitgevoerd na de eerste 3,500 infecties zou bijvoorbeeld een echte seroprevalentie van 0.1% aantonen, terwijl het gebruik van een assay met een specificiteit van 99% naar verwachting valse positieven zou opleveren. in 10 keer zoveel monsters. Serologische onderzoeken zijn echter nuttig om de voortgang van de pandemie te volgen zodra deze zich heeft gevestigd en hebben het potentiële voordeel dat alle infecties worden opgespoord, ongeacht het symptoomprofiel. De bevindingen in dit rapport kennen tenminste drie beperkingen. Ten eerste zijn de hier gepresenteerde gegevens retrospectief. Hoewel ze geografisch divers zijn, kunnen ze geen zo definitief beeld geven van de overdracht als beschikbaar zou zijn als er onmiddellijk uitgebreide tests beschikbaar zouden zijn geweest na ontdekking van het virus. Ten tweede: sommige van de geciteerde onderzoeken en mogelijk andere gaan door met het retrospectief testen van monsters en vinden mogelijk eerdere gevallen dan die in dit rapport worden gepresenteerd. Ten slotte beperkte de relatieve fylogenetische homogeniteit van SARS-CoV-2 wereldwijd in januari en begin februari wat kon worden afgeleid uit genomische analyse. Er zijn maar weinig landen die de invoer en aanhoudende verspreiding van COVID-19 hebben vermeden. In de Verenigde Staten circuleert SARS-CoV-2 nu op grote schaal na verschillende importen uit China, Europa en elders. In de VS worden stappen ondernomen volksgezondheidsstelsel om de indicatoren van SARS-CoV-2-activiteit te verbeteren, inclusief uitbreiding van syndromale surveillance onder spoedeisende hulpafdelingen en vergroting van de beschikbaarheid van tests voor SARS-CoV-2. Gezien de waarschijnlijkheid dat het grootste deel van de VS.

#herbouwreizen

WAT U UIT DIT ARTIKEL MOET NEMEN:

  • Ten slotte is er sprake van drie gevallen: één bij een inwoner van Californië die op 6 februari stierf, een tweede bij een andere inwoner van dezelfde provincie die op 17 februari stierf, en een derde bij een ongeïdentificeerde passagier of bemanningslid aan boord van een cruiseschip in de Stille Oceaan dat vertrok San Francisco bevestigt op 11 februari de cryptische verspreiding van het virus begin februari.
  • In 14 provincies met vroege door de gemeenschap opgelopen gevallen van COVID-19 werd geen substantiële toename waargenomen in het aandeel van COVID-19-achtige ziekten (koorts en hoesten of kortademigheid of moeite met ademhalen, of de vermelding van een diagnostische code voor het coronavirus) vóór 28 februari.
  • Ten derde suggereerde analyse van virale RNA-sequenties uit vroege gevallen dat een enkele viruslijn, direct of indirect uit China geïmporteerd, tussen 18 januari en 9 februari in de Verenigde Staten begon te circuleren, gevolgd door verschillende SARS-CoV-2-importen uit Europa.

<

Over de auteur

Hoofdopdrachteditor

Hoofdredacteur van de opdracht is Oleg Siziakov

Delen naar...